49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3432 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3432  hypothetical protein  100 
 
 
81 aa  159  9e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701401  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3086  hypothetical protein  97.53 
 
 
81 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6249  hypothetical protein  73.44 
 
 
92 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.65781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1582  hypothetical protein  73.44 
 
 
92 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6725  hypothetical protein  73.44 
 
 
92 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.968891  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2425  hypothetical protein  67.14 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2613  hypothetical protein  67.14 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3386  hypothetical protein  67.14 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1202  hypothetical protein  67.14 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0341  hypothetical protein  67.14 
 
 
82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139131  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6395  hypothetical protein  64.29 
 
 
78 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6100  hypothetical protein  64.29 
 
 
78 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3421  hypothetical protein  72.58 
 
 
82 aa  87  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6003  hypothetical protein  60.32 
 
 
65 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46966  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5256  hypothetical protein  65.08 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0576565  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0642  hypothetical protein  62.9 
 
 
65 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2359  hypothetical protein  59.68 
 
 
65 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3317  hypothetical protein  59.68 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426969  normal  0.539995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0422  hypothetical protein  57.14 
 
 
65 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.689334  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2703  hypothetical protein  53.97 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2455  hypothetical protein  53.97 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0728  hypothetical protein  53.97 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0742  hypothetical protein  53.97 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0909  hypothetical protein  53.97 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0243  hypothetical protein  53.97 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2374  hypothetical protein  53.97 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0602  hypothetical protein  53.97 
 
 
69 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0622  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2728  hypothetical protein  49.21 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0564162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2600  hypothetical protein  49.21 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187029  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2064  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635897  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2675  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2704  hypothetical protein  50.79 
 
 
65 aa  62  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28168  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6003  hypothetical protein  49.21 
 
 
65 aa  62  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.339564  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5483  hypothetical protein  46.77 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.705452  hitchhiker  0.000639682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5133  hypothetical protein  49.21 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987085  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7026  hypothetical protein  41.27 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12669  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7076  hypothetical protein  44.44 
 
 
65 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2090  hypothetical protein  48.33 
 
 
68 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6080  hypothetical protein  41.27 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0723054 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6490  hypothetical protein  39.68 
 
 
81 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00628682  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1339  hypothetical protein  39.68 
 
 
81 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.618355  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6333  hypothetical protein  41.27 
 
 
69 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196579  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5603  hypothetical protein  41.27 
 
 
69 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.887809  normal  0.69254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4805  hypothetical protein  41.43 
 
 
133 aa  50.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3762  hypothetical protein  44.26 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.668308  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4839  hypothetical protein  44.26 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3914  hypothetical protein  43.94 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1137  hypothetical protein  38.98 
 
 
73 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>