16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2768 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_2768  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  224  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625742  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2364  hypothetical protein  86.09 
 
 
115 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5964  hypothetical protein  45.35 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2199  hypothetical protein  40.38 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2826  hypothetical protein  34.57 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2961  hypothetical protein  29.9 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7046  hypothetical protein  36.23 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.811007  normal  0.0223659 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2384  hypothetical protein  34.21 
 
 
104 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0360  hypothetical protein  43.86 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0030  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1219  hypothetical protein  36.51 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399917  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0648  hypothetical protein  36.51 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1415  hypothetical protein  36.51 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.170103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1445  hypothetical protein  36.51 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0505  hypothetical protein  36.51 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3788  hypothetical protein  33.8 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.939806 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>