23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1371 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1371  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1307  putative transmembrane protein  98.44 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0447673  normal  0.727033 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1430  hypothetical protein  89.58 
 
 		 192 aa  324  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.011317  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1855  transmembrane protein  50.97 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1462  hypothetical protein  50.94 
 
 		 213 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.499251  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2023  hypothetical protein  38.41 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1313  hypothetical protein  42.33 
 
 		 274 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1892  hypothetical protein  36.59 
 
 		 199 aa  92.8  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6087  hypothetical protein  39.51 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1990  hypothetical protein  39.51 
 
 		 202 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2010  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2023  hypothetical protein  38.79 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425891  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2430  hypothetical protein  47.79 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.283363 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1294  hypothetical protein  38.79 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3288  hypothetical protein  38.79 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0072457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1523  hypothetical protein  38.79 
 
 		 217 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2456  hypothetical protein  38.18 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1707  hypothetical protein  48.53 
 
 		 242 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5300  hypothetical protein  36.75 
 
 		 201 aa  87.8  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.693609  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2404  hypothetical protein  39.16 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267711  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1286  hypothetical protein  42.25 
 
 		 197 aa  84.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0405669  normal  0.365164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2547  hypothetical protein  38.98 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2057  hypothetical protein  35.26 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>