22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1236 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1236  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  270  5.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1175  hypothetical protein  96.95 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.399464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1301  hypothetical protein  85.16 
 
 		 129 aa  229  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0790  hypothetical protein  57.48 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606872  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0934  hypothetical protein  51.97 
 
 		 140 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  30.77 
 
 		 338 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0323  putative RNase H  33.01 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00762994  normal  0.0205227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4145  hypothetical protein  30.63 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4440  hypothetical protein  29.55 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251753  normal  0.785852 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0126  hypothetical protein  29.07 
 
 		 118 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02448  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59590  hypothetical protein  30.08 
 
 		 119 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132336  hitchhiker  4.1623000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0142  hypothetical protein  28.45 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0443  hypothetical protein  31.82 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  26.27 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0989  hypothetical protein  24.09 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.022347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3601  hypothetical protein  29.57 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2113  hypothetical protein  35.96 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1152  hypothetical protein  25.45 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0852  hypothetical protein  29.52 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  37.08 
 
 		 336 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0162  hypothetical protein  25.49 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128402  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>