17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4100 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4100  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128205  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3434  hypothetical protein  80.52 
 
 		 77 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2764  hypothetical protein  67.57 
 
 		 76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.563488  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0651  hypothetical protein  60.81 
 
 		 74 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4000  hypothetical protein  54.05 
 
 		 76 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2155  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  61.04 
 
 		 77 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0962171 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7046  transposase  54.05 
 
 		 77 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9093  hypothetical protein  54.05 
 
 		 77 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.313804  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0689  hypothetical protein  54.05 
 
 		 77 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3406  hypothetical protein  54.05 
 
 		 77 aa  87  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1790  preprotein translocase subunit SecA (ATPase, RNA helicase)  53.85 
 
 		 79 aa  86.7  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.896296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3515  hypothetical protein  48.65 
 
 		 80 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780841  normal  0.248126 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4505  ISPpu13, transposase Orf3  42.86 
 
 		 82 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3984  ISPpu13, transposase Orf3  38.67 
 
 		 86 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3115  ISPpu13, transposase Orf3  38.67 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.542239 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0199  hypothetical protein  59.52 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2207  hypothetical protein  28.99 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000213611  unclonable  0.0000000000580335 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>