13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2066 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2066  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  645    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  76.23 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3512  hypothetical protein  74.69 
 
 		 323 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652436  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1782  hypothetical protein  66.89 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1139  hypothetical protein  60.84 
 
 		 321 aa  363  3e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.888592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1399  hypothetical protein  62.14 
 
 		 320 aa  362  6e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.647959  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3048  hypothetical protein  59.34 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0708  hypothetical protein  27.95 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0697  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0670  hypothetical protein  27.76 
 
 		 331 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  40 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  36.36 
 
 		 369 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  35.56 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>