10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1133 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3319  hypothetical protein  82.55 
 
 		 149 aa  255  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.822642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3807  hypothetical protein  83.22 
 
 		 149 aa  250  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3431  hypothetical protein  83.22 
 
 		 149 aa  238  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3634  hypothetical protein  79.73 
 
 		 149 aa  237  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.386824 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0009  hypothetical protein  65.77 
 
 		 171 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5371  hypothetical protein  38.61 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0267488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3322  hypothetical protein  42.68 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.200606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2357  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0134717  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2695  hypothetical protein  45.28 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>