20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0902 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0902  CoxF protein  100 
 
 		 55 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0674992  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  81.25 
 
 		 54 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  81.25 
 
 		 54 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  82.61 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  70.37 
 
 		 56 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  70.37 
 
 		 56 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0831  protein CoxF  76 
 
 		 58 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0528979  normal  0.245845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  48.08 
 
 		 55 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4585  putative CoxF  85.11 
 
 		 52 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  59.09 
 
 		 54 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0817  putative CoxF  85.11 
 
 		 53 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  56.82 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  52 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  52 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0873642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  52.27 
 
 		 60 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0521  hypothetical protein  58.82 
 
 		 46 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  50 
 
 		 50 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0470  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.652133  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0476  hypothetical protein  41.82 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.288807  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1043  hypothetical protein  55.88 
 
 		 45 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>