19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4421 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  867    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  64.99 
 
 
423 aa  565  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  28.34 
 
 
349 aa  143  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  26.67 
 
 
347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  25 
 
 
348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  27.91 
 
 
342 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  29.24 
 
 
280 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  27.55 
 
 
466 aa  107  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  29.68 
 
 
358 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  27.16 
 
 
294 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  29.49 
 
 
304 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  27.55 
 
 
478 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  27 
 
 
470 aa  97.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  27.59 
 
 
469 aa  93.2  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  26.49 
 
 
485 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  26.75 
 
 
501 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  25.67 
 
 
495 aa  86.7  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 
470 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  25.94 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>