42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4338 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4338  metallophosphoesterase  100 
 
 
327 aa  675    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0132154  decreased coverage  0.00100802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0131  metallophosphoesterase  85.93 
 
 
327 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0993  Icc protein-like phosphoesterase  44.58 
 
 
326 aa  274  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0772  metallophosphoesterase  39.38 
 
 
326 aa  265  5.999999999999999e-70  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0765989  normal  0.0617226 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0772  hypothetical protein  44.55 
 
 
321 aa  265  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0875  metallophosphoesterase  39.32 
 
 
342 aa  261  1e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0056  metallophosphoesterase  36.2 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484307  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0535  metallophosphoesterase  35.26 
 
 
324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1932  metallophosphoesterase  31.53 
 
 
321 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.10129  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0835  metallophosphoesterase  32.81 
 
 
326 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0876  phosphoesterase  30.56 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.788657 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0541  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2799  conserved hypothetical protein  28.23 
 
 
309 aa  95.9  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.309872  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1254  metallophosphoesterase  33.97 
 
 
214 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0194  metallophosphoesterase  36.42 
 
 
208 aa  85.9  9e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0270  metallophosphoesterase  34.74 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.407111  normal  0.0834706 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0984  metallophosphoesterase  30.17 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0988  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
227 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.165399  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1512  metallophosphoesterase  32.69 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000329408 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3615  phosphoesterase, Icc protein-like  32.32 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00617704  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0695  metallophosphoesterase  29.81 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0227916  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0957  metallophosphoesterase  31.87 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.332804  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1145  hypothetical protein  29.14 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.890478 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1723  metallophosphoesterase  30.63 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2142  metallophosphoesterase  32.74 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0682  metallophosphoesterase  30.22 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0388677  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3228  hypothetical protein  28.48 
 
 
219 aa  67  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00856854  normal  0.0495142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0792  metallophosphoesterase  30.6 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0537  metallophosphoesterase  39.09 
 
 
283 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2514  serine/threonine protein phosphatase family protein  27.78 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0653  metallophosphoesterase  24.72 
 
 
283 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0932  metallophosphoesterase  27.53 
 
 
213 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.205067  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2319  phosphoesterase, Icc protein-like protein  38.1 
 
 
225 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1063  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
226 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.895321  normal  0.0287479 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0035  metallophosphoesterase  32.43 
 
 
222 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.525214  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2617  metallophosphoesterase  34.4 
 
 
240 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1325  metallophosphoesterase  26.47 
 
 
213 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.597673 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1168  metallophosphoesterase  27.1 
 
 
213 aa  56.6  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1324  metallophosphoesterase  28.48 
 
 
213 aa  55.8  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.763713  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0339  metallophosphoesterase  35.16 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0897854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2697  phosphoesterase related to the Icc protein-like protein  27.12 
 
 
261 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1372  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.81 
 
 
207 aa  49.7  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>