23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3961 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  7e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  58.45 
 
 		 171 aa  165  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  36.07 
 
 		 241 aa  84  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2156  hypothetical protein  36.24 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  42.11 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0436  hypothetical protein  31.47 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.033779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  26.72 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  30 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  29.37 
 
 		 349 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  29.71 
 
 		 266 aa  53.1  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  28.67 
 
 		 312 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3427  hypothetical protein  44.83 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  31.97 
 
 		 222 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  31.21 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  31.21 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  31.91 
 
 		 244 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  30.3 
 
 		 301 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  28.06 
 
 		 301 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1682  hypothetical protein  40.38 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  27.78 
 
 		 350 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4382  hypothetical protein  23.08 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29623  hitchhiker  0.00278326 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0280  hypothetical protein  34.15 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>