21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1128 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  76.02 
 
 		 501 aa  778    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1011    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  52.41 
 
 		 485 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  24.73 
 
 		 349 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  26.25 
 
 		 342 aa  96.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  26.52 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  30.07 
 
 		 294 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  27.38 
 
 		 280 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  26.78 
 
 		 423 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  25.64 
 
 		 348 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  23.36 
 
 		 347 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  25.67 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  26.32 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  27.72 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  29.17 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  25.79 
 
 		 453 aa  69.7  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  26.54 
 
 		 358 aa  66.6  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  28.32 
 
 		 466 aa  57.8  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0216  urate catabolism protein  23 
 
 		 301 aa  47.8  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.668034  normal  0.0222485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  22.15 
 
 		 288 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  26.92 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>