31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1018 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  336  8e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  56.13 
 
 		 155 aa  167  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  64.23 
 
 		 139 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  40.14 
 
 		 241 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  36.22 
 
 		 232 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  37.06 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  32.35 
 
 		 266 aa  60.8  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  33.8 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3427  hypothetical protein  52 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  33.1 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  29.32 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  38.04 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  37.11 
 
 		 301 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  37.11 
 
 		 348 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  37.11 
 
 		 348 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  35.51 
 
 		 301 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  33.9 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0436  hypothetical protein  33.08 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.033779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2156  hypothetical protein  32.67 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.446469 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0643  hypothetical protein  26.52 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.908214  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  28.57 
 
 		 350 aa  48.1  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4383  hypothetical protein  32.05 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.199282  hitchhiker  0.00298903 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1332  hypothetical protein  23.36 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0280  hypothetical protein  38.04 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2525  hypothetical protein  29.69 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2004  hypothetical protein  28.91 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.425505 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1244  hypothetical protein  28.68 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01120  predicted inner membrane protein  30.77 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28200  hypothetical protein  31.17 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.260447  normal  0.180975 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4382  hypothetical protein  23.39 
 
 		 134 aa  40.8  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29623  hitchhiker  0.00278326 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>