13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5920 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5920  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  261  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5255  hypothetical protein  69.84 
 
 		 119 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0917  hypothetical protein  58.82 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3573  hypothetical protein  55.56 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4794  hypothetical protein  55.56 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5805  hypothetical protein  62.22 
 
 		 69 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370861 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3807  hypothetical protein  53.7 
 
 		 65 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0772852  hitchhiker  0.00532281 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4249  hypothetical protein  78.79 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4711  hypothetical protein  59.09 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414183  normal  0.011152 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5977  hypothetical protein  52.27 
 
 		 74 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.355962  normal  0.578827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2933  hypothetical protein  58.82 
 
 		 62 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0190325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2829  hypothetical protein  41.94 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00104908  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0945  hypothetical protein  48.39 
 
 		 58 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>