34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4807 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4807  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  190  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.81615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4805  hypothetical protein  48.31 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7076  hypothetical protein  40.26 
 
 		 65 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2359  hypothetical protein  42.11 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5133  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987085  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3762  hypothetical protein  37.66 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.668308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4839  hypothetical protein  37.66 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2090  hypothetical protein  39.47 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.975538 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0602  hypothetical protein  38.16 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0909  hypothetical protein  38.16 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2374  hypothetical protein  38.16 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0243  hypothetical protein  38.16 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2064  hypothetical protein  38.36 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.635897  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2675  hypothetical protein  38.36 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.358279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2704  hypothetical protein  38.36 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0622  hypothetical protein  39.73 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7026  hypothetical protein  32.91 
 
 		 116 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0642  hypothetical protein  33.77 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6003  hypothetical protein  34.67 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6080  hypothetical protein  35.9 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0723054 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3421  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0728  hypothetical protein  36.99 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0422  hypothetical protein  35.06 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.689334  normal  0.700985 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2455  hypothetical protein  36.99 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0742  hypothetical protein  36.99 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2703  hypothetical protein  36.99 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6003  hypothetical protein  38.36 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2613  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.28973  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2600  hypothetical protein  38.36 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3386  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1202  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0341  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139131  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2728  hypothetical protein  38.36 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0564162  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2425  hypothetical protein  38.36 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>