17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4709 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4709  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  354  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2306  hypothetical protein  56.82 
 
 		 176 aa  167  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.256089  normal  0.206542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2456  hypothetical protein  32.18 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2616  fimbrial assembly  30.34 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.863286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2290  hypothetical protein  30.06 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.050869  normal  0.803647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3481  hypothetical protein  30.06 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.605279 
 
 
-
 
NC_003296  RS02974  hypothetical protein  34.86 
 
 		 172 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.510739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2465  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1984  fimbrial assembly  31.39 
 
 		 181 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207869  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29130  hypothetical protein  34.92 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.46889  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1297  transmembrane protein  34.44 
 
 		 178 aa  62  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.111921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2586  transmembrane protein  27.04 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2417  fimbrial assembly  34.21 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1339  hypothetical protein  28.96 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3225  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1436  hypothetical protein  25.9 
 
 		 167 aa  48.1  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0317201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3881  hypothetical protein  28.18 
 
 		 452 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>