13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2961 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2961  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2384  hypothetical protein  33.33 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4639  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3724  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3797  hypothetical protein  31.33 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0790953 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2826  hypothetical protein  31.33 
 
 		 163 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2768  hypothetical protein  29.9 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0360  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0648  hypothetical protein  31.75 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0505  hypothetical protein  31.75 
 
 		 89 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1219  hypothetical protein  31.75 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.399917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1415  hypothetical protein  31.75 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.170103  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1445  hypothetical protein  31.75 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>