54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2214 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  411  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0189524  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0706  hypothetical protein  75.76 
 
 		 218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0154953  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1271  hypothetical protein  49.19 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.335245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1030  hypothetical protein  49.19 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.738741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1809  hypothetical protein  49.19 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1788  hypothetical protein  49.19 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0136  hypothetical protein  49.19 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1759  hypothetical protein  49.19 
 
 		 208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.342395  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1961  hypothetical protein  49.19 
 
 		 443 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0136529  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2525  hypothetical protein  47.85 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0224585  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2187  putative ParB-like nuclease  43 
 
 		 205 aa  170  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0352754  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1716  putative ParB-like nuclease  45.7 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4678  hypothetical protein  44.92 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0352084  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1420  hypothetical protein  45.16 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1460  putative ParB-like nuclease  45.16 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.530245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3351  hypothetical protein  43 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.789599  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4518  putative ParB-like nuclease  43.81 
 
 		 208 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1514  putative ParB-like nuclease  45.65 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  hitchhiker  0.00751547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2235  Putative ParB-like nuclease  45.5 
 
 		 207 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1058  hypothetical protein  45.65 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1538  hypothetical protein  45.65 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0704  hypothetical protein  41.33 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.15967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2660  putative ParB-like nuclease  48.12 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.683597  normal  0.548694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3524  hypothetical protein  42.29 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0701  Putative ParB-like nuclease  42.25 
 
 		 205 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0740  Putative ParB-like nuclease  41.71 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2350  Putative ParB-like nuclease  41.71 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.309294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0727  putative ParB-like nuclease  41.18 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal  0.881395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4261  putative ParB-like nuclease  43.3 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4374  hypothetical protein  42.55 
 
 		 226 aa  137  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.093636  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0880  Putative ParB-like nuclease  39.68 
 
 		 205 aa  131  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.141868 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4378  hypothetical protein  38.95 
 
 		 217 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0750226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5254  putative ParB-like nuclease  39.38 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0513173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1668  hypothetical protein  36.41 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0409439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56990  hypothetical protein  36.65 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4955  hypothetical protein  36.13 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13631  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05691  hypothetical protein  25.26 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.222417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0974  hypothetical protein  26.18 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0887  hypothetical protein  26.63 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_93854  predicted protein  32.92 
 
 		 340 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00630097  normal  0.0600499 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3403  putative lipoprotein  31.78 
 
 		 380 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3368  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2530  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2351  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1126  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0264  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3409  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1245  putative lipoprotein  32.31 
 
 		 380 aa  48.5  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0653  putative ParB-like nuclease  31.3 
 
 		 378 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.488055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0686  hypothetical protein  30.53 
 
 		 378 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0203  hypothetical protein  30.53 
 
 		 378 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3772  hypothetical protein  29.77 
 
 		 378 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2067  putative ParB-like nuclease  28.35 
 
 		 305 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>