23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1462 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1462  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.499251  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1855  transmembrane protein  67.76 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1307  putative transmembrane protein  49.06 
 
 		 192 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0447673  normal  0.727033 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1371  hypothetical protein  49.06 
 
 		 192 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108082  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1430  hypothetical protein  51.42 
 
 		 192 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.011317  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2010  hypothetical protein  39.77 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6087  hypothetical protein  37.93 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1990  hypothetical protein  37.93 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5300  hypothetical protein  39.44 
 
 		 201 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.693609  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2023  hypothetical protein  38.1 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1294  hypothetical protein  38.1 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3288  hypothetical protein  38.1 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0072457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1523  hypothetical protein  38.1 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2456  hypothetical protein  38.1 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2404  hypothetical protein  40.88 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2023  hypothetical protein  43.38 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1892  hypothetical protein  40.74 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2430  hypothetical protein  48.51 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.283363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1313  hypothetical protein  41.03 
 
 		 274 aa  89.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1707  hypothetical protein  47.01 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1286  hypothetical protein  42.03 
 
 		 197 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0405669  normal  0.365164 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2547  hypothetical protein  38.39 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2057  hypothetical protein  36.24 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>