18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1327 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1327  phenol hydroxylase region  100 
 
 		 118 aa  245  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3359  phenol hydroxylase region  77.59 
 
 		 118 aa  193  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0210  phenol hydroxylase region  74.14 
 
 		 118 aa  186  5.999999999999999e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2792  phenol hydroxylase region  74.58 
 
 		 118 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3551  Phenol hydroxylase conserved region  73.55 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4627  Phenol hydroxylase conserved region  73.55 
 
 		 121 aa  184  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5684  phenol hydroxylase region  68.03 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2967  phenol hydroxylase region  66.38 
 
 		 118 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.193953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3112  Phenol hydroxylase conserved region  56.3 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2281  phenol hydrolase gammma subunit  58.47 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3793  phenol hydroxylase region  49.15 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000826781  hitchhiker  0.00225505 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3305  phenol hydrolase gammma subunit  50.43 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1783  phenol hydroxylase region  49.17 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.78708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1703  phenol hydroxylase region  48.33 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.395752  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30720  Multi-component phenol hydoxylase, gamma subunit; LapO  47.37 
 
 		 118 aa  100  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.51766  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08820  Phenol hydroxylase subunit P4  40.34 
 
 		 119 aa  92  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.786664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3307  phenol hydroxylase region  40.34 
 
 		 119 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0527  phenol hydroxylase subunit P4  24.51 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>