14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2537 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2537  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  729    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1692  hypothetical protein  31.16 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.12804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5304  hypothetical protein  31.16 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.374361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2376  hypothetical protein  32.25 
 
 		 413 aa  99.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2508  hypothetical protein  27.95 
 
 		 448 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0432  hypothetical protein  28.17 
 
 		 408 aa  85.1  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05404  hypothetical protein  28.23 
 
 		 419 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001467  hypothetical protein  27.84 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3194  hypothetical protein  27.64 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1432  hypothetical protein  33.9 
 
 		 425 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.440324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2657  hypothetical protein  29.27 
 
 		 421 aa  54.3  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5039  hypothetical protein  20.2 
 
 		 488 aa  50.4  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0499  hypothetical protein  31.43 
 
 		 527 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.785616 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1096  hypothetical protein  24.46 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000541198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>