12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2220 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 166 aa  314  4e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0710  rod shape-determining protein MreD  32.1 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0572  hypothetical protein  39.77 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.726102  normal  0.420167 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1165  hypothetical protein  38.04 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0532  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.019067  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  35.05 
 
 		 167 aa  50.8  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  44.29 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  36.9 
 
 		 172 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  42.11 
 
 		 171 aa  47.8  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  34.13 
 
 		 167 aa  47.4  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  41.18 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>