20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1559 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  951    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  29.24 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  28.2 
 
 		 347 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  26.51 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  26.28 
 
 		 348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  27.85 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  27.55 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  26.52 
 
 		 495 aa  96.3  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  28.31 
 
 		 453 aa  96.3  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  30.31 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  27.89 
 
 		 501 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  27.08 
 
 		 423 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  27.04 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  26.61 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  30.86 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  31.43 
 
 		 358 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  26.09 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05615  hypothetical protein  21.19 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.776737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  26.21 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  27.22 
 
 		 469 aa  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>