27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1372 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  330  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  40.13 
 
 		 145 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  41.83 
 
 		 151 aa  114  6.9999999999999995e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  42.77 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  42.95 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  49.07 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  37.25 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  38.82 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  38.36 
 
 		 142 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  45.16 
 
 		 145 aa  101  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  38.56 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  34.19 
 
 		 146 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  39.47 
 
 		 146 aa  97.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  38.76 
 
 		 118 aa  94.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  40.26 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  34.29 
 
 		 146 aa  87  9e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  36 
 
 		 418 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  36.05 
 
 		 141 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  38.46 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  32.68 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  33.11 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  35.85 
 
 		 196 aa  47.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1903  hypothetical protein  30.91 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0401096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0380  hypothetical protein  32.71 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  33.06 
 
 		 136 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0149  hypothetical protein  28.18 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  30.97 
 
 		 133 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>