14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0714 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  100 
 
 		 369 aa  726    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  26.72 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  27 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  27 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  26.82 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  35.96 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  26.64 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  27 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  29.17 
 
 		 397 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  34.78 
 
 		 341 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  34.83 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  26.62 
 
 		 340 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  34.09 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>