13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5609 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5609  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 388 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000732254 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5684  glycosyl transferase group 1  62.08 
 
 		 386 aa  483  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.164534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0148  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.864478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01300  hypothetical protein  24.84 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1201  WbwZ  23.04 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1755  hypothetical protein  28.8 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  30.16 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1251  GalNAc alpha-1,4-transferase  28.21 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.16 
 
 		 366 aa  43.5  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_54621  glycosyl transferase, family 1  25.71 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  25.89 
 
 		 357 aa  43.1  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  27.59 
 
 		 394 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>