19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1699 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1699  protein of unknown function DUF1127  100 
 
 
47 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745671  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1501  protein of unknown function DUF1127  100 
 
 
47 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.941747 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2653  hypothetical protein  82.98 
 
 
47 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1179  hypothetical protein  74.47 
 
 
47 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175131  normal  0.0358301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1791  hypothetical protein  51.11 
 
 
46 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.601351  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5370  hypothetical protein  45.65 
 
 
48 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.157659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0075  hypothetical protein  45.45 
 
 
50 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0044933  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6602  protein of unknown function DUF1127  47.62 
 
 
48 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000878075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2481  hypothetical protein  40.43 
 
 
49 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.123002  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5661  protein of unknown function DUF1127  47.62 
 
 
48 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.647025  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2193  protein of unknown function DUF1127  54.29 
 
 
50 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1180  hypothetical protein  40.43 
 
 
66 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.278308  normal  0.0615222 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6084  protein of unknown function DUF1127  42.86 
 
 
48 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1502  protein of unknown function DUF1127  45.24 
 
 
48 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5587  hypothetical protein  42.86 
 
 
48 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.512418  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1700  protein of unknown function DUF1127  42.86 
 
 
48 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.966723  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3375  hypothetical protein  40 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0891  hypothetical protein  44.44 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0895  hypothetical protein  44.44 
 
 
48 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0744293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>