12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6422 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6422  hypothetical protein  100 
 
 
609 aa  1266    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297493  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6226  hypothetical protein  75.08 
 
 
613 aa  966    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.08261 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5778  hypothetical protein  44.88 
 
 
618 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.350966 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3682  hypothetical protein  44.73 
 
 
623 aa  485  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.33517  normal  0.702936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0636  hypothetical protein  25.95 
 
 
308 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1940  hypothetical protein  25.82 
 
 
331 aa  64.3  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4989  hypothetical protein  29.41 
 
 
318 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4940  hypothetical protein  28.82 
 
 
318 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4812  hypothetical protein  28.82 
 
 
318 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67216  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66120  hypothetical protein  28.81 
 
 
318 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5736  hypothetical protein  28.25 
 
 
330 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0528  hypothetical protein  27.65 
 
 
318 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0728399 
 
 
-
 
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