8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4242 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4242    100 
 
 		 234 bp  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5199    84.47 
 
 		 497 bp  165  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  82.43 
 
 		 1050 bp  131  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7019    84.09 
 
 		 1037 bp  95.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.584067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  83.72 
 
 		 1065 bp  89.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  86.75 
 
 		 1053 bp  77.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1946  hypothetical protein  100 
 
 		 423 bp  46.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.508099  normal  0.0126694 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 		 2094 bp  46.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>