18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0605 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0605  hypothetical protein  100 
 
 
46 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0645  hypothetical protein  84.78 
 
 
46 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0521  hypothetical protein  70.45 
 
 
46 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.688075  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1043  hypothetical protein  76.19 
 
 
45 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0672  hypothetical protein  55 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.482572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0727  protein CoxF  56.41 
 
 
55 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.076153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0263  protein CoxF  46.34 
 
 
50 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.120067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0258  CoxF protein  55.26 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.962663  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3460  CoxF protein  55.26 
 
 
54 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0744  hypothetical protein  46.51 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0200822  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4790  putative CoxF  56.41 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3456  conserved protein CoxF  47.37 
 
 
54 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0764  CoxF protein  50 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272671  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0226  CoxF protein  50 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4503  hypothetical protein  48.78 
 
 
54 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.740711  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0030  protein CoxF  45 
 
 
54 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148285  normal  0.786254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3584  protein CoxF  42.11 
 
 
54 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3260  protein CoxF  42.11 
 
 
54 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0873642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>