32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3979 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3979  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1372  phosphoesterase, PA-phosphatase related  51.96 
 
 
240 aa  187  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3303  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.51 
 
 
242 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.306243  normal  0.430535 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4168  phosphoesterase, PA-phosphatase related  53.23 
 
 
237 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0537  PAP2 family protein  51.37 
 
 
293 aa  178  7e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0694  phosphoesterase PA-phosphatase related  51.37 
 
 
223 aa  177  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000042298  unclonable  0.000000000111992 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2238  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  51.08 
 
 
242 aa  176  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1848  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.89 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2021  hypothetical protein  43.09 
 
 
237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4862  phosphoesterase PA-phosphatase related  43.39 
 
 
235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2865  hypothetical protein  32.1 
 
 
206 aa  62.8  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.423571 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4138  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
217 aa  62  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4419  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.74 
 
 
217 aa  62  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2666  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.2 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000403275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3589  putative PAP2 family protein  26.99 
 
 
219 aa  51.6  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000468424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5133  PAP2 family protein  27.75 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5140  PAP2 family protein  27.12 
 
 
215 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000194372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4721  PAP2 family protein  27.12 
 
 
215 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00298694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0102  PAP2 family protein  29.11 
 
 
215 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000373231  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0673  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.18 
 
 
205 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.918939  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0734  Fatty acid desaturase  30.77 
 
 
486 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.130713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4866  PAP2 family protein  27.17 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282445  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4706  PAP2 family protein  27.17 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0195137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5104  PAP2 family protein  27.17 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5238  PAP2 family protein  27.17 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.108629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5138  PAP2 family protein  27.78 
 
 
215 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000319321  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3885  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.7 
 
 
205 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4824  PAP2 family protein  26.59 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00045347  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2361  putative dual specificity phosphatase  28.93 
 
 
428 aa  45.8  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1413  hypothetical protein  35.16 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2878  hypothetical protein  28.03 
 
 
230 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.259578  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1291  PAP2 family phosphatase  26.58 
 
 
439 aa  41.6  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>