53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1435 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1435  hypothetical protein  100 
 
 		 771 aa  1545    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2129  hypothetical protein  25.83 
 
 		 744 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796066  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0949  hypothetical protein  25.14 
 
 		 751 aa  168  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0779  hypothetical protein  24.78 
 
 		 766 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0786  hypothetical protein  30.42 
 
 		 729 aa  165  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341709 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2114  hypothetical protein  23.76 
 
 		 787 aa  160  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190473  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2314  hypothetical protein  29.23 
 
 		 735 aa  156  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0816  hypothetical protein  27.5 
 
 		 751 aa  152  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0751  hypothetical protein  25.16 
 
 		 763 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58690  hypothetical protein  27.43 
 
 		 751 aa  144  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0875  hypothetical protein  25.55 
 
 		 842 aa  144  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0738842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5140  hypothetical protein  26.59 
 
 		 749 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2241  hypothetical protein  33.07 
 
 		 782 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0953  hypothetical protein  24.79 
 
 		 766 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4406  hypothetical protein  27.53 
 
 		 721 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0699  protein of unknown function DUF1631  27.61 
 
 		 773 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268383  normal  0.290029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0822  hypothetical protein  27.95 
 
 		 719 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0788  hypothetical protein  27.44 
 
 		 745 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0764  hypothetical protein  24.66 
 
 		 781 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3053  hypothetical protein  25.98 
 
 		 732 aa  128  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0811  hypothetical protein  27.44 
 
 		 717 aa  127  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.083655  normal  0.106889 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0820  cell division protein FtsZ  24.15 
 
 		 764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4133  hypothetical protein  25.72 
 
 		 687 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04577  hypothetical protein  26.56 
 
 		 763 aa  106  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.29 
 
 		 1249 aa  98.6  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0847  hypothetical protein  28.87 
 
 		 890 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0279  hypothetical protein  23.2 
 
 		 773 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4085  hypothetical protein  23.93 
 
 		 784 aa  93.2  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0688006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3353  hypothetical protein  25.25 
 
 		 784 aa  89.7  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.739095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0836  hypothetical protein  24.71 
 
 		 801 aa  89.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5117  protein of unknown function DUF1631  25.4 
 
 		 804 aa  87.8  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0346  hypothetical protein  25.43 
 
 		 850 aa  87  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4642  hypothetical protein  25.79 
 
 		 795 aa  84.3  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1247  hypothetical protein  23.77 
 
 		 782 aa  82.8  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02373  hypothetical protein  24.87 
 
 		 802 aa  82.4  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2170  hypothetical protein  23.03 
 
 		 737 aa  82  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3864  hypothetical protein  24.77 
 
 		 790 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0969  hypothetical protein  24.88 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.852631  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1201  hypothetical protein  24.7 
 
 		 742 aa  75.1  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2607  hypothetical protein  27.39 
 
 		 741 aa  72  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.978979  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4760  hypothetical protein  25.78 
 
 		 447 aa  70.5  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22061  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0851  hypothetical protein  24.63 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.509842  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3883  hypothetical protein  23.46 
 
 		 780 aa  67.4  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4643  hypothetical protein  24.83 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0761  hypothetical protein  24.12 
 
 		 828 aa  60.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0848  hypothetical protein  23.64 
 
 		 824 aa  58.2  0.0000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2229  hypothetical protein  27.42 
 
 		 1201 aa  55.5  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2904  hypothetical protein  26.28 
 
 		 867 aa  51.2  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4528  hypothetical protein  21.79 
 
 		 854 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0429  hypothetical protein  25 
 
 		 727 aa  48.9  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.9239 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3274  protein of unknown function DUF1631  33.85 
 
 		 760 aa  47  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2036  hypothetical protein  25.57 
 
 		 473 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2088  hypothetical protein  23.44 
 
 		 524 aa  44.3  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>