69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2833 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  100 
 
 		 168 aa  337  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  77.78 
 
 		 171 aa  258  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  66.43 
 
 		 169 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  65.73 
 
 		 174 aa  192  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  65.03 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  48.32 
 
 		 171 aa  148  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  46.98 
 
 		 168 aa  140  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  45.52 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  42.18 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  43.62 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  43.62 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  42.86 
 
 		 183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  43.45 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  45.58 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  40.12 
 
 		 168 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  42.25 
 
 		 170 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  47.62 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  39.6 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  40.37 
 
 		 183 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  40.37 
 
 		 183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  39.75 
 
 		 183 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  43.84 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  41.22 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  38.51 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  39.47 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  40.37 
 
 		 183 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  39.47 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  41.61 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  40.76 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  41.61 
 
 		 176 aa  103  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  33.33 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  39.16 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  39.07 
 
 		 169 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  33.33 
 
 		 175 aa  99.8  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  37.41 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  36.11 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  29.49 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  27.4 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  28.75 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2131  Rare lipoprotein B  34.01 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.1085 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  24.66 
 
 		 187 aa  54.3  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  29.56 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.48 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.09 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  24.5 
 
 		 182 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2278  rare lipoprotein B  28.77 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  25.42 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0401  rare lipoprotein B-like protein  27.89 
 
 		 179 aa  50.8  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.258768  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  29.33 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08990  hypothetical protein  27.33 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.97 
 
 		 184 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  24.86 
 
 		 220 aa  48.1  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  23.78 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  25.85 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  25.95 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  27.61 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.85 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.85 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.85 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  25.47 
 
 		 201 aa  42  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2583  rare lipoprotein B  27.27 
 
 		 164 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.259622  normal  0.446935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>