23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1855 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1855  transmembrane protein  100 
 
 
207 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1462  hypothetical protein  67.76 
 
 
213 aa  236  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.499251  normal  0.378449 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1371  hypothetical protein  50.49 
 
 
192 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108082  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1430  hypothetical protein  50.97 
 
 
192 aa  192  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.011317  normal  0.0709181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1307  putative transmembrane protein  50.49 
 
 
192 aa  191  5e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0447673  normal  0.727033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6087  hypothetical protein  42.56 
 
 
202 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1990  hypothetical protein  42.56 
 
 
202 aa  115  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2010  hypothetical protein  39.9 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.824797  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5300  hypothetical protein  39.77 
 
 
201 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.693609  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2456  hypothetical protein  40.88 
 
 
217 aa  104  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2023  hypothetical protein  40.88 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.425891  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1294  hypothetical protein  40.88 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3288  hypothetical protein  40.88 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0072457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1523  hypothetical protein  40.88 
 
 
217 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171341  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1892  hypothetical protein  39.11 
 
 
199 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41262  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2404  hypothetical protein  43.17 
 
 
217 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267711  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2023  hypothetical protein  39.66 
 
 
199 aa  99.4  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1313  hypothetical protein  40.61 
 
 
274 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1286  hypothetical protein  41.24 
 
 
197 aa  92  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0405669  normal  0.365164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2430  hypothetical protein  49.25 
 
 
245 aa  91.3  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.283363 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1707  hypothetical protein  48.51 
 
 
242 aa  88.2  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2547  hypothetical protein  39.66 
 
 
194 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2057  hypothetical protein  40.52 
 
 
183 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>