12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3953 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3953  hypothetical protein  100 
 
 
281 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.196171  normal  0.279999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1115  hypothetical protein  72.04 
 
 
282 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.598353  normal  0.517802 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  42.65 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3172  hypothetical protein  43.6 
 
 
243 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0642666  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1736  hypothetical protein  25.22 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1736  hypothetical protein  25.22 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1920  hypothetical protein  34.04 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0790  hypothetical protein  28.9 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2203  hypothetical protein  27.71 
 
 
255 aa  53.9  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.29608  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2178  hypothetical protein  27.11 
 
 
255 aa  52.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2081  hypothetical protein  27.06 
 
 
276 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4333  hypothetical protein  26.16 
 
 
254 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>