23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3627 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3627  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  285  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1018  hypothetical protein  63.55 
 
 		 171 aa  146  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3961  hypothetical protein  44.44 
 
 		 155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.599897  normal  0.163149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4056  hypothetical protein  36.84 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2522  hypothetical protein  36.19 
 
 		 348 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169031  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3135  hypothetical protein  36.19 
 
 		 348 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6486  hypothetical protein  38.1 
 
 		 301 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0298  hypothetical protein  33.87 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.532788 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3151  hypothetical protein  37.89 
 
 		 301 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.185832 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1248  hypothetical protein  36.63 
 
 		 266 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4554  hypothetical protein  36.36 
 
 		 232 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2145  hypothetical protein  37.37 
 
 		 204 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3190  hypothetical protein  32.38 
 
 		 349 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0127935  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3073  hypothetical protein  31.43 
 
 		 312 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.764314  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3427  hypothetical protein  51.92 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0072  hypothetical protein  33.64 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3132  hypothetical protein  31.58 
 
 		 350 aa  45.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880988  hitchhiker  0.00102312 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0436  hypothetical protein  33.61 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.033779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0151  hypothetical protein  31.58 
 
 		 244 aa  44.3  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0643  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.908214  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3317  hypothetical protein  25.24 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0280  hypothetical protein  28.33 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.346938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1682  hypothetical protein  34.48 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.828048  normal  0.140339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>