12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2656 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1507  hypothetical protein  82.24 
 
 		 464 aa  741    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000660776  normal  0.36544 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2656  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  909    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0271609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1823  hypothetical protein  46.91 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3432  hypothetical protein  42.03 
 
 		 461 aa  353  4e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1785  hypothetical protein  47.37 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2083  hypothetical protein  42.11 
 
 		 408 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0595  hypothetical protein  27.4 
 
 		 208 aa  54.3  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00485606  hitchhiker  0.00425938 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1021  hypothetical protein  34.15 
 
 		 474 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4349  hypothetical protein  32.88 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4350  hypothetical protein  36.36 
 
 		 210 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0693  hypothetical protein  31.25 
 
 		 107 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0254  hypothetical protein  31.73 
 
 		 374 aa  47.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.872026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>