19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0766 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0766  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  882    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.249559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4421  hypothetical protein  64.99 
 
 
420 aa  588  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.491633  normal  0.170958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1140  hypothetical protein  28.44 
 
 
348 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1116  hypothetical protein  29.52 
 
 
349 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1110  hypothetical protein  27.71 
 
 
347 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.506924  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0383  hypothetical protein  27.73 
 
 
342 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1599  hypothetical protein  28.75 
 
 
466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1832  hypothetical protein  26.58 
 
 
280 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2497  hypothetical protein  27.12 
 
 
294 aa  114  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3172  hypothetical protein  30.32 
 
 
304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.296474 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1737  hypothetical protein  27.98 
 
 
469 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1559  hypothetical protein  27.68 
 
 
478 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462896  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1128  hypothetical protein  26.78 
 
 
495 aa  100  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3424  hypothetical protein  27.95 
 
 
358 aa  99.8  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1371  hypothetical protein  26.36 
 
 
470 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0814  hypothetical protein  24.77 
 
 
485 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0883  hypothetical protein  26.38 
 
 
453 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.985622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3968  hypothetical protein  25.08 
 
 
501 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0443888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0581  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 
470 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>