12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0190 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 391 aa  793    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.374414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0367  hypothetical protein  73.54 
 
 		 393 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2386  Csx10 family CRISPR-associated RAMP protein  26.83 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1440  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  30.1 
 
 		 402 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  28.9 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0982  hypothetical protein  31.36 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1803  CRISPR-associated RAMP Csx10 family protein  24.63 
 
 		 423 aa  54.3  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3211  hypothetical protein  27.1 
 
 		 533 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2053  hypothetical protein  22.63 
 
 		 415 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20520  hypothetical protein  31.53 
 
 		 328 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.859157  normal  0.365267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1227  hypothetical protein  33.63 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.444898  normal  0.624113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1008  hypothetical protein  35.51 
 
 		 808 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226186  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>