10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3401 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1839  hypothetical protein  39.01 
 
 		 2497 aa  1210    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.285317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3401  hypothetical protein  100 
 
 		 2353 aa  4760    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02084  hypothetical protein  34.35 
 
 		 2483 aa  978    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05403  hypothetical protein  48.47 
 
 		 2208 aa  1669    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05479  hypothetical protein  71.43 
 
 		 2338 aa  3289    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0543187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03833  hypothetical protein  47.2 
 
 		 2710 aa  1678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2130  SKWP protein 6  39.38 
 
 		 770 aa  324  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.931378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  35.5 
 
 		 3754 aa  72  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3048  hypothetical protein  25 
 
 		 643 aa  45.8  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3295  hypothetical protein  25 
 
 		 643 aa  45.8  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>