71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2743 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2743  putative lipoprotein B precursor transmembrane  100 
 
 		 169 aa  342  2e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2572  Rare lipoprotein B  85.03 
 
 		 174 aa  283  5.999999999999999e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.613264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2982  Rare lipoprotein B  84.43 
 
 		 174 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2833  rare lipoprotein B  65.38 
 
 		 168 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2972  rare lipoprotein B  67.13 
 
 		 171 aa  201  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1201  Rare lipoprotein B  46.21 
 
 		 175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.877221  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2587  rare lipoprotein B  46.91 
 
 		 183 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.890824  hitchhiker  0.0000000000573442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3785  rare lipoprotein B  45.95 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4604  rare lipoprotein B  45.21 
 
 		 168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0543  rare lipoprotein B  38.36 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1228  putative lipoprotein  42.94 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3414  putative lipoprotein  42.94 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0369  putative lipoprotein  42.94 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3449  putative lipoprotein  42.94 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2639  putative lipoprotein  42.94 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2452  putative lipoprotein  42.94 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3379  rare lipoprotein B  41.36 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000235513 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0550  rare lipoprotein B  42.33 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.951717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1072  rare lipoprotein B  43.54 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3450  putative lipoprotein  44.67 
 
 		 176 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.978876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1212  putative lipoprotein  44 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0622  rare lipoprotein B  40.85 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0576  rare lipoprotein B  41.72 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0512  rare lipoprotein B  40.56 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6002  rare lipoprotein B  40.82 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13554 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4547  rare lipoprotein B  40.94 
 
 		 168 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3741  rare lipoprotein B  42.48 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0664658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0172  rare lipoprotein B  42.57 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0655  rare lipoprotein B  42.57 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.36505  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2731  rare lipoprotein B  43.54 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3265  Rare lipoprotein B  41.5 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3916  rare lipoprotein B  41.5 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0577  rare lipoprotein B  40.82 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.330293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0759  rare lipoprotein B  38.19 
 
 		 163 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0423  Rare lipoprotein B  46.21 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0217  putative lipoprotein B precursor  42.86 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0233  rare lipoprotein B precursor  34.55 
 
 		 175 aa  98.6  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2444  putative lipoprotein B precursor transmembrane  35.66 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.553692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2156  rare lipoprotein B  35.66 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0480  rare lipoprotein B  33.81 
 
 		 190 aa  82.8  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0255  rare lipoprotein B precursor  30.86 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2664  rare lipoprotein B  27.15 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.167141  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3309  hypothetical protein  27.33 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0269686 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1743  putative lipoprotein B precursor  27.21 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0430569  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1097  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.57 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.590366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1300  hypothetical protein  26.8 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1301  hypothetical protein  26.8 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1452  rare lipoprotein B  24 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.334843  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4813  lipoprotein, putative  26.67 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1186  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.99 
 
 		 184 aa  51.2  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1721  rare lipoprotein B  30.72 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3145  LPS-assembly lipoprotein RlpB  30.41 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12210  hypothetical protein  24.68 
 
 		 207 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1206  LPS-assembly lipoprotein RlpB  28.76 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.730747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1120  hypothetical protein  24.68 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.904149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1190  rare lipoprotein B  23.95 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3480  rare lipoprotein B  26.9 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0408224  hitchhiker  0.000000129712 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3787  rare lipoprotein B  28.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0786655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1310  rare lipoprotein B  26.47 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2959  LPS-assembly lipoprotein RlpB  25.32 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0480  hypothetical protein  26.38 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1377  rare lipoprotein B precursor  26.47 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0925703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4353  rare lipoprotein B  24.85 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2911  Rare lipoprotein B  26.03 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3703  rare lipoprotein B  25.6 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00988017  hitchhiker  0.0000022488 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1175  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.22 
 
 		 189 aa  42.4  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4958  rare lipoprotein B  26.51 
 
 		 201 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3016  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.8 
 
 		 207 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.446987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1843  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.8 
 
 		 207 aa  40.8  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2927  LPS-assembly lipoprotein RlpB  26.8 
 
 		 207 aa  40.8  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2144  rare lipoprotein B  29.25 
 
 		 173 aa  40.8  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>