14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2304 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2304  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  400  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.221973  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4707  hypothetical protein  53.33 
 
 		 202 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.813409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2618  hypothetical protein  44.55 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.891939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29110  hypothetical protein  48.39 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.189229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2292  hypothetical protein  36.54 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2458  hypothetical protein  40.62 
 
 		 169 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1986  hypothetical protein  35 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0936785  normal  0.343947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2467  hypothetical protein  43.55 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.564543  normal  0.906023 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2584  putative prolin-rich transmembrane protein  39.13 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3883  hypothetical protein  35.48 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1299  prolin-rich transmembrane protein  40.71 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.033846  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02976  prolin-rich transmembrane protein  35.48 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3227  proline-rich transmembrane protein  41.67 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2415  putative prolin-rich transmembrane protein  26.47 
 
 		 200 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>