10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1839 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1839  hypothetical protein  100 
 
 		 2497 aa  5001    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.285317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3401  hypothetical protein  39.42 
 
 		 2353 aa  1248    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02084  hypothetical protein  48.38 
 
 		 2483 aa  1852    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05403  hypothetical protein  40.6 
 
 		 2208 aa  1200    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05479  hypothetical protein  38.61 
 
 		 2338 aa  1210    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0543187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03833  hypothetical protein  40.92 
 
 		 2710 aa  1360    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2130  SKWP protein 6  49.1 
 
 		 770 aa  470  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.931378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  29.03 
 
 		 3754 aa  56.2  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3295  hypothetical protein  29.79 
 
 		 643 aa  51.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3048  hypothetical protein  29.79 
 
 		 643 aa  50.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>