32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0007 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0007  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  350  7e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.145458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2169  metallophosphoesterase  31.43 
 
 		 273 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.957834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3588  metallophosphoesterase  35.16 
 
 		 321 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1191  metallophosphoesterase  34.02 
 
 		 283 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.28829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0348  metallophosphoesterase  34.07 
 
 		 392 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.395263  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4151  metallophosphoesterase  31 
 
 		 381 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2033  metallophosphoesterase  26.67 
 
 		 420 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2658  metallophosphoesterase  31.87 
 
 		 413 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00191858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1144  metallophosphoesterase  37.14 
 
 		 282 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1273  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1204  metallophosphoesterase  35.71 
 
 		 282 aa  45.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.229661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1016  metallophosphoesterase  31.68 
 
 		 368 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1153  cytoplasmic membrane protein  29.89 
 
 		 369 aa  43.9  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.199237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4175  Ser/Thr protein phosphatase family protein  30.69 
 
 		 368 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0219  twin-arginine translocation pathway signal  38.89 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2738  metallophosphoesterase  30.53 
 
 		 275 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.474487 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2809  metallophosphoesterase  30.99 
 
 		 379 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1166  Ser/Thr protein phosphatase family protein  31.11 
 
 		 368 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.706411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1032  phosphoesterase  29.81 
 
 		 287 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6905  putative metallophosphoesterase ykuE  29.27 
 
 		 313 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.155819  normal  0.323813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1010  phosphoesterase  29.81 
 
 		 368 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1009  phosphoesterase  29.81 
 
 		 368 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.899772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1265  phosphoesterase  29.81 
 
 		 368 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1189  phosphoesterase  29.81 
 
 		 368 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.689871 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0514  metallophosphoesterase  29.21 
 
 		 330 aa  42.4  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.468726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2315  metallophosphoesterase  32.95 
 
 		 395 aa  41.6  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.277964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3359  metallophosphoesterase  31.37 
 
 		 385 aa  41.6  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1544  metallophosphoesterase  32.95 
 
 		 395 aa  41.6  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2412  putative phosphoesterase  31.96 
 
 		 387 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51749  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1212  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.85 
 
 		 357 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4868  metallophosphoesterase  34.34 
 
 		 425 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.225896  normal  0.165863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2487  calcineurin-like phosphoesterase  30.17 
 
 		 348 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>