40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0006 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0006  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  219  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0720243  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3428  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  85.05 
 
 		 107 aa  191  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4811  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  72.9 
 
 		 107 aa  169  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1581  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  70.75 
 
 		 108 aa  168  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285184 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1663  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  71.43 
 
 		 108 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1183  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  71.43 
 
 		 108 aa  166  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1637  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  71.7 
 
 		 108 aa  164  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7132  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  68.22 
 
 		 109 aa  163  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1562  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  66.98 
 
 		 108 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1380  hypothetical protein  66.67 
 
 		 107 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4802  hypothetical protein  67.62 
 
 		 109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1644  protein tyrosine phosphatase-like protein  64.15 
 
 		 107 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.294535  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44960  hypothetical protein  65.71 
 
 		 109 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3825  hypothetical protein  66.67 
 
 		 109 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3946  phosphatase  59.22 
 
 		 108 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3038  hypothetical protein  60.95 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.959689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2810  hypothetical protein  60 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3461  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2929  hypothetical protein  60.4 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3432  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  56.73 
 
 		 106 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2603  hypothetical protein  50 
 
 		 108 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3543  hypothetical protein  54.29 
 
 		 108 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2559  phosphatase  48.08 
 
 		 106 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02886  phosphatase  54.9 
 
 		 108 aa  117  6e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4974  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.81 
 
 		 105 aa  107  8.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359638 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1113  protein-tyrosine-phosphatase  42.99 
 
 		 107 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0718  hypothetical protein  43.81 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2721  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.76 
 
 		 115 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203534  normal  0.0645973 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1082  hypothetical protein  50.52 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3901  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.16 
 
 		 109 aa  94.4  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0160871 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0181  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00160916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  46.94 
 
 		 107 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0497104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4364  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.92 
 
 		 115 aa  91.3  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  0.301624 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  45.92 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0119958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1065  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.18 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  27.59 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  25.51 
 
 		 146 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  25.88 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  24.49 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>