19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0583 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0583  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  274  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.866818 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0486  hypothetical protein  94.29 
 
 		 151 aa  259  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.609033  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2260  hypothetical protein  64.96 
 
 		 140 aa  186  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3618  hypothetical protein  64.18 
 
 		 138 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.852641  normal  0.135457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2205  hypothetical protein  65.65 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1320  hypothetical protein  65.69 
 
 		 140 aa  166  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0990906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1577  hypothetical protein  65.69 
 
 		 140 aa  166  7e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.401749  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0429  hypothetical protein  48.51 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0510307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3038  hypothetical protein  51.16 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0740  hypothetical protein  43.18 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3970  hypothetical protein  43.94 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0789  hypothetical protein  42.42 
 
 		 136 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0137  hypothetical protein  41.98 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.171445  normal  0.390949 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0016  hypothetical protein  39.66 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0187  hypothetical protein  40.31 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0216  hypothetical protein  40.31 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.378879  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0579  hypothetical protein  40.94 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0787  hypothetical protein  28.23 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>