11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02084 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1839  hypothetical protein  48.18 
 
 		 2497 aa  1805    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.285317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3401  hypothetical protein  34.41 
 
 		 2353 aa  1008    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.332578  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02084  hypothetical protein  100 
 
 		 2483 aa  5039    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05403  hypothetical protein  36.51 
 
 		 2208 aa  1062    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.166405  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05479  hypothetical protein  35.94 
 
 		 2338 aa  1025    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0543187 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03833  hypothetical protein  36 
 
 		 2710 aa  1022    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2130  SKWP protein 6  32.33 
 
 		 770 aa  237  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.931378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3048  hypothetical protein  30.67 
 
 		 643 aa  65.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3295  hypothetical protein  30.67 
 
 		 643 aa  65.9  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0483  hypothetical protein  28.65 
 
 		 3754 aa  55.8  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.38288 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  27.4 
 
 		 1119 aa  47  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>