24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2109 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2109  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3332  hypothetical protein  85.29 
 
 		 238 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.307359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2256  hypothetical protein  77.73 
 
 		 238 aa  391  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.690803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3239  hypothetical protein  57.71 
 
 		 234 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6065  hypothetical protein  58.22 
 
 		 238 aa  268  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2717  hypothetical protein  57.14 
 
 		 233 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1441  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 		 236 aa  164  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.364896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0955  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1328  NUDIX hydrolase  40.81 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1149  NUDIX hydrolase  39.73 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0980  NUDIX hydrolase  36.6 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0220325 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0671  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.338441  normal  0.549779 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2672  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2899  NUDIX hydrolase  38.43 
 
 		 243 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2794  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.815602 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1933  NUDIX hydrolase  32.63 
 
 		 249 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2774  hypothetical protein  34.4 
 
 		 251 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.689253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2477  NUDIX hydrolase  32.37 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1818  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1332  nudix hydrolase  29.86 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2731  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0380829  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1375  hypothetical protein  25.79 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3658  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 282 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1477  NUDIX hydrolase  34.91 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.867637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>