14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1985 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1985  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.767846  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3463  hypothetical protein  76.19 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0791609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2111  hypothetical protein  75 
 
 		 67 aa  103  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00358078  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1819  hypothetical protein  73.33 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.33037 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1176  hypothetical protein  70.49 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.829742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1421  hypothetical protein  70.15 
 
 		 70 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3163  hypothetical protein  54.24 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0298135  normal  0.0124686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1084  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0473834 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0914  hypothetical protein  54.24 
 
 		 64 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1347  gene transfer agent (GTA) orfg10  43.64 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000217924  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1419  hypothetical protein  39.34 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518955  normal  0.0974788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1423  hypothetical protein  39.66 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0592329  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1697  hypothetical protein  39.66 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11211  normal  0.300589 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1139  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>