13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1947 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1947  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.757191  normal  0.0957628 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3512  hypothetical protein  85.76 
 
 		 323 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652436  normal  0.207811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2066  hypothetical protein  76.23 
 
 		 324 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1782  hypothetical protein  69.49 
 
 		 316 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.368952  normal  0.0393077 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1399  hypothetical protein  61.42 
 
 		 320 aa  367  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.647959  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1139  hypothetical protein  58.95 
 
 		 321 aa  352  5e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.888592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3048  hypothetical protein  57.84 
 
 		 320 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.442334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0708  hypothetical protein  29.45 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0670  hypothetical protein  29.5 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.485034 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0697  hypothetical protein  29.13 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4665  hypothetical protein  43.02 
 
 		 376 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0715  hypothetical protein  34.15 
 
 		 369 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1120  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212047  normal  0.911923 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>